根據防潮及防水程度的不同，一般把防水瓦楞紙箱分為疏水型、擋水型及耐水型紙箱三大類。

　　疏水型瓦楞紙箱防水能力最弱，可做暫時性防水使用，主要是在紙箱表面涂布蠟或硅油等制得，遇到一次大量的水，或長時間和水接觸時，疏水加工面的防水效果會完全喪失。原紙生產時，在紙漿中加入抗水劑或在紙張表面進行施膠處理以使瓦楞原紙獲得疏水性。另外，也可以通過涂布機對紙箱內外表面進行抗水劑的涂布。當然，根據使用的要求不同，可以對紙箱內表面或外表面進行防水處理。使用中，由于經過了表面涂布加工，紙箱的耐磨性提高，可減少流通中紙箱表面脫皮和產生紙末的現象。由于防水效果較差，在反復流通，如多次進出冷庫后，紙箱疏水能力不斷下降，最終防水能力與普通紙箱相同。

　　水蒸汽或水接觸擋水型瓦楞紙箱表面時幾乎不被吸收。其擋水性能也主要采用涂布以石蠟為主的樹脂或瀝青乳液獲得。也可以在紙箱表面覆膜或使用淋膜紙生產紙箱，如果紙箱兩面都進行涂布處理，則擋水性更好。

　　耐水瓦楞紙箱的防水能力更好，即使紙箱浸入水中，紙箱也難以吸水而強度下降。其防水工藝主要采用浸涂石蠟或樹脂完成。面紙、里紙及芯紙都具有較好的防水能力，因此，紙箱生產時粘合劑的選擇至關重要。